木材本身也是影響木材防腐劑有效性的重要因素——木材的心材與邊材:
如之前所述,處理木材心材和邊材難易程度大不相同。例如,南方松樹和樹苗易于處理,心材難以處理。同樣,歐洲紅松和樟子松的邊材易于處理,心材難以處理。而輻射松,邊材易于處理,心材更容易處理。因此,心材與邊材的百分比是決定其是否適合作為防腐木材的因素。為此,防腐蝕工業通常將木材分為木材和心材。
帶有大邊材的木材稱為邊材樹種。具有寬心材和窄心材的樹被稱為心材樹種。例如,如南方松、馬尾松的邊材較寬,屬邊材樹種。歐洲雪松,樟子松和落葉松具有狹窄的邊材,是心材樹種。雖然名稱不正確,但有些人熟悉將邊材樹種易于處理的物種,以及作為難處理物種的心材物種。